schrodinger.trajectory package

Modules for prody-related analysis

Subpackages

• schrodinger.trajectory.prody package
  • Submodules
    • schrodinger.trajectory.prody.compare module
    • schrodinger.trajectory.prody.crosscorrelation module
    • schrodinger.trajectory.prody.ensemble module
    • schrodinger.trajectory.prody.main module
    • schrodinger.trajectory.prody.main2 module
    • schrodinger.trajectory.prody.mode module
    • schrodinger.trajectory.prody.modeset module
    • schrodinger.trajectory.prody.nma module
    • schrodinger.trajectory.prody.pca module
    • schrodinger.trajectory.prody.test_arrow module
    • schrodinger.trajectory.prody.writenmd module
      • NMD Format
        • Description
        • Data fields
        • Autoload Trick

Submodules

• schrodinger.trajectory.BondRotator module
• schrodinger.trajectory.Torsion module
• schrodinger.trajectory.analysis module
• schrodinger.trajectory.analysistool module
• schrodinger.trajectory.atomselection module
• schrodinger.trajectory.automatic_analysis_generator module
• schrodinger.trajectory.cmsstructure module
• schrodinger.trajectory.desmondsimulation module
• schrodinger.trajectory.ffstructure module
• schrodinger.trajectory.hydrophobiccontactfinder module
• schrodinger.trajectory.jcoupling module
• schrodinger.trajectory.lipid_analysis module
• schrodinger.trajectory.order_parameters module
• schrodinger.trajectory.pbc_manager module
• schrodinger.trajectory.proteininteractionsfinder module
• schrodinger.trajectory.protliginteractionfinder module
• schrodinger.trajectory.rmsd2d module
• schrodinger.trajectory.saltbridgefinder module