schrodinger.application.mopac.results71 module

A module to parse and store the results of a MOPAC7.1 calculation. It interfaces directly with the Fortran code to populate the output variables from memory.

class schrodinger.application.mopac.results71.MopacResults71

Bases: schrodinger.application.mopac.mopac_results.MopacResults

A class to parse and store the results of a MOPAC7.1 calculation.

MULLIK = 'MULLIK'

ESP = 'ESP'

SUPER = 'SUPER'

UHF = 'UHF'

PLOTESP = 'PLOTESP'

PLOTALIE = 'PLOTALIE'

PLOTALEA = 'PLOTALEA'

scf_OK = 1

scf_FAIL = 2

exit_status_OK = 0

exit_status_FATAL = -1

exit_status_BAD_INPUT = 1

energy_prop = 'r_NDDO_NDDO_Heat_of_Formation'

method_prop = 's_NDDO_SemiEmpirical_Method'

homo_prop = 'r_NDDO_HOMO_Energy'

lumo_prop = 'r_NDDO_LUMO_Energy'

ahomo_prop = 'r_NDDO_Alpha_HOMO_Energy'

alumo_prop = 'r_NDDO_Alpha_LUMO_Energy'

bhomo_prop = 'r_NDDO_Beta_HOMO_Energy'

blumo_prop = 'r_NDDO_Beta_LUMO_Energy'

hardness_prop = 'r_NDDO_Molecular_Hardness'

eneg_prop = 'r_NDDO_Molecular_Electronegativity'

se_tot_prop = 'r_NDDO_Total_Electrophilic_Superdelocalizability'

sn_tot_prop = 'r_NDDO_Total_Nucleophilic_Superdelocalizability'

sr_tot_prop = 'r_NDDO_Total_Radical_Superdelocalizability'

asp_tot_prop = 'r_NDDO_Total_Atom_Self_Polarizability'

dipole_prop = 'r_NDDO_Dipole'

dipole_x_prop = 'r_NDDO_Dipole_X'

dipole_y_prop = 'r_NDDO_Dipole_Y'

dipole_z_prop = 'r_NDDO_Dipole_Z'

dipole_esp_prop = 'r_NDDO_Dipole_ESP'

dipole_esp_x_prop = 'r_NDDO_Dipole_ESP_X'

dipole_esp_y_prop = 'r_NDDO_Dipole_ESP_Y'

dipole_esp_z_prop = 'r_NDDO_Dipole_ESP_Z'

min_esp_prop = 'r_NDDO_Min_ESP_On_Mol_Surface'

max_esp_prop = 'r_NDDO_Max_ESP_On_Mol_Surface'

mean_esp_prop = 'r_NDDO_Mean_ESP_On_Mol_Surface'

mean_pos_esp_prop = 'r_NDDO_Mean_Pos_ESP_On_Mol_Surface'

mean_neg_esp_prop = 'r_NDDO_Mean_Neg_ESP_On_Mol_Surface'

sig_pos_esp_prop = 'r_NDDO_Pos_ESP_Variance_On_Mol_Surface'

sig_neg_esp_prop = 'r_NDDO_Neg_ESP_Variance_On_Mol_Surface'

sig_tot_esp_prop = 'r_NDDO_Tot_ESP_Variance_On_Mol_Surface'

balance_esp_prop = 'r_NDDO_ESP_Balance_On_Mol_Surface'

local_pol_esp_prop = 'r_NDDO_Avg_Abs_Dev_from_Mean_ESP_On_Mol_Surface'

min_alie_prop = 'r_NDDO_Min_ALIE_On_Mol_Surface'

max_alie_prop = 'r_NDDO_Max_ALIE_On_Mol_Surface'

mean_alie_prop = 'r_NDDO_Mean_ALIE_On_Mol_Surface'

mean_pos_alie_prop = 'r_NDDO_Mean_Pos_ALIE_On_Mol_Surface'

mean_neg_alie_prop = 'r_NDDO_Mean_Neg_ALIE_On_Mol_Surface'

sig_pos_alie_prop = 'r_NDDO_Pos_ALIE_Variance_On_Mol_Surface'

sig_neg_alie_prop = 'r_NDDO_Neg_ALIE_Variance_On_Mol_Surface'

sig_tot_alie_prop = 'r_NDDO_Tot_ALIE_Variance_On_Mol_Surface'

balance_alie_prop = 'r_NDDO_ALIE_Balance_On_Mol_Surface'

local_pol_alie_prop = 'r_NDDO_Avg_Abs_Dev_from_Mean_ALIE_On_Mol_Surface'

min_alea_prop = 'r_NDDO_Min_ALEA_On_Mol_Surface'

max_alea_prop = 'r_NDDO_Max_ALEA_On_Mol_Surface'

mean_alea_prop = 'r_NDDO_Mean_ALEA_On_Mol_Surface'

mean_pos_alea_prop = 'r_NDDO_Mean_Pos_ALEA_On_Mol_Surface'

mean_neg_alea_prop = 'r_NDDO_Mean_Neg_ALEA_On_Mol_Surface'

sig_pos_alea_prop = 'r_NDDO_Pos_ALEA_Variance_On_Mol_Surface'

sig_neg_alea_prop = 'r_NDDO_Neg_ALEA_Variance_On_Mol_Surface'

sig_tot_alea_prop = 'r_NDDO_Tot_ALEA_Variance_On_Mol_Surface'

balance_alea_prop = 'r_NDDO_ALEA_Balance_On_Mol_Surface'

local_pol_alea_prop = 'r_NDDO_Avg_Abs_Dev_from_Mean_ALEA_On_Mol_Surface'

mulliken_charge_prop = 'r_NDDO_Mulliken_Charge'

atomic_charge_prop = 'r_NDDO_NDDO_Charge'

esp_charge_prop = 'r_NDDO_ESP_Charge'

fe_prop = 'r_NDDO_Electrophilic_Frontier_Electron_Density'

fn_prop = 'r_NDDO_Nucleophilic_Frontier_Electron_Density'

se_prop = 'r_NDDO_Electrophilic_Superdelocalizability'

sn_prop = 'r_NDDO_Nucleophilic_Superdelocalizability'

sr_prop = 'r_NDDO_Radical_Superdelocalizability'

asp_prop = 'r_NDDO_Atom_Self_Polarizability'

maxat_esp_prop = 'r_NDDO_Max_surface_ESP'

minat_esp_prop = 'r_NDDO_Min_surface_ESP'

maxat_alie_prop = 'r_NDDO_Max_surface_ALIE'

minat_alie_prop = 'r_NDDO_Min_surface_ALIE'

maxat_alea_prop = 'r_NDDO_Max_surface_ALEA'

minat_alea_prop = 'r_NDDO_Min_surface_ALEA'

__init__()

Initialize self. See help(type(self)) for accurate signature.

structure

A Schrodinger Structure object which is populated with output data.

method

Type:str

name of semi-empirical method (i.e. a MOPAC keyword)

output_file

Type:str

name of output file generated by MOPAC.

set_method(value)

set_output_file(value)

set_return_code(value)

set_count(value)

check_key(keyword)

If the given keyword was set in the job specification, return True, otherwise return False.

set_final_structure(structure, filename)

Set the final structure and update the coordinates to match the final geometry.

statusOk()

Check the summary status of the job, looking at SCF status and return code of the main routine.

Return True if all is ok, False if not.

get_error_text()

Get the error text set during the main MOPAC calculation. If there is no error text, returns the empty string.

write_vis_files()

This function is not needed in this API