schrodinger.application.desmond.packages package¶
Subpackages¶
- schrodinger.application.desmond.packages.enhanced_sampling package
- schrodinger.application.desmond.packages.msys package
- Subpackages
- Submodules
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.atomsel module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.grease module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.groups module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.knot module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.posre module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.reorder module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.sequence module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.thermalize module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.update module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.validate module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.vdw module
- schrodinger.application.desmond.packages.msys.wrap module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1 package
- Subpackages
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins package
- Submodules
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.angles module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.atoms module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.bondfields module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.bonds module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.charges module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.cmap module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.dihedrals6atom module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.exclusions module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.impropers module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.inplanewags module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.mass module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.pairs_es module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.pairs_es_balanced module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.pairs_lj module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.polarizable module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.propers module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.screening module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.sparsify_exclusions_and_pairs module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.torsion_torsion module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.ureybradley module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.vdw1 module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.vdw1_14 module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins.virtuals module
- Submodules
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.systest package
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr package
- Submodules
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.alchemical_map module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.elements module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.fep module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.isomorph module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.iviparr module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.maeview module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.version module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.viparr module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.viparr_merge module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.viparr_plugins_util module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.viparr_residue module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.viparr.viparr_util module
- Submodules
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr1.plugins package
- Subpackages
Submodules¶
- schrodinger.application.desmond.packages.Ark module
- schrodinger.application.desmond.packages.analysis module
- schrodinger.application.desmond.packages.cui module
- schrodinger.application.desmond.packages.energygroup module
- schrodinger.application.desmond.packages.gdesmond_utils module
- schrodinger.application.desmond.packages.parch module
- schrodinger.application.desmond.packages.restraint module
- schrodinger.application.desmond.packages.staf module
- schrodinger.application.desmond.packages.timer module
- schrodinger.application.desmond.packages.topo module
- schrodinger.application.desmond.packages.traj module
- schrodinger.application.desmond.packages.traj_util module
- schrodinger.application.desmond.packages.viparr module